تهدف الهيئة إلى المساهمة في تنفيذ مسئوليات الوزارة في مجال تقديم الخدمات الطبية والصحية للمواطنين من خلال إدارة وتشغيل المستشفى والإرتقاء بمستوى خدماته وتنميتها وتنويعها بما يلبي حاجة المجتمع الصحية والطبية ويسهم في تحقيق أغراض التنمية الشاملة وفقاً للسياسة الصحية العامة للدولة.